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Biochemical and Functional Analysis of gamma-Protocadherin Intracellular Signaling Pathways

Pilpel, Noam

German Title: Biochemical and Functional Analysis of gamma-Protocadherin Intracellular Signaling Pathways

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Abstract

The precisely organized complexity of the central nervous system (CNS) requires an enormous number of specific cell-cell interactions, presumably mediated by a diverse array of membrane associated proteins. The classic cadherins are known to play essential roles in the maintenance of neuronal connectivity and synaptic plasticity. Three complex genomic loci encoding proteins of the cadherin superfamily, the -, -, and - clustered protocadherins (Pcdhs), have been hypothesized to take part in this task. Their large number, diverse expression pattern during neurogenesis, and partial synaptic localization suggest a role in synaptogenesis. The genomic architecture of the clustered Pcdhs is reminiscent of the immunoglobulin and T-cell receptor clusters which confer the huge variety of antibody molecules: within each cluster, exons encoding variable extracellular and transmembrane domains are alternatively spliced onto a cluster-specific conserved intracellular domain. Thus, Pcdhs confer molecular diversity on the cell surface, with conserved signaling mechanisms in the cytoplasm. However, the physiological role of Pcdhs as well as the reason for the diversity of extracellular domains and the conservation of the intracellular domain have remained elusive. Our goal was the elucidation of the signal transduction pathways downstream of -Pcdh. To this end, we attempted to identify proteins that interact with the conserved intracellular domain of -Pcdhs (-ICD). We purified specific polyclonal antibodies targeted against the -ICD, and used them to immunoprecipitate interacting proteins from mouse forebrain lysates. Mass spectrometry analysis and subsequent co-immunoprecipitation identified novel proteins involved in signal transduction pathways related to cell cycle control, synaptic plasticity and memory formation. To study the role of -Pcdh intracellular signaling in vivo, we additionally established a viral gene-delivery system into neonatal (P0) mouse brains. This method enabled us to efficiently overexpress the -ICD, which allowed us to study the intracellular signaling of -Pcdhs. Using this system we uncovered novel physiological effects of -ICD overexpression in inhibitory synapses of the cortex, with possible implications for synaptic transmission and plasticity.

Translation of abstract (German)

Für die exakten Verschaltungen im zentralen Nervensystem, die wahrscheinlich durch unterschiedlichste membranassoziierte Proteine bestimmt werden, sind sehr viele spezifische Zellinteraktionen notwendig. Klassische Cadherine sind dabei nicht nur für die Integrität der neuronalen Vernetzung, sondern auch für synaptische Plastizität essenziell. Eine Unterklasse der Cadherine, die auf drei komplexen genomischen Locigeclusterten -, -, und -Protocadherine, sind wahrscheinlich auch daran beteiligt. Insbesondere ihre hohe Anzahl, ihr unterschiedliches Expressionsmuster während der Neurogenese und ihre synaptische Verankerung legen die Vermutung auf wichtige Funktionen während der Synaptogenese nahe. Die genomische Anordnung dieser geclusterten Protocadherine erinnert strukturell stark an Immunglobulin und T-Zell Rezeptor Gen-Cluster, welche für die enorme Vielfalt von Antikörpervarianten verantwortlich sind. Dabei werden unterschiedliche Cluster-spezifische Exone, welche die Extrazelluläre- und Transmembrandomäne kodieren, an Exone für eine einheitliche intrazelluläre Domäne gespleisst. Geclusterte Protocadherine vernetzen daher die molekulare Vielfalt an der Zelloberfläche mit einheitlichen zytoplasmatischen Signalwegen. Leider sind bis heute weder physiologische Relevanz noch Grund dieser extrazellulären Vielfalt in Verbindung mit einheitlichen intrazellulären Signalwegen bekannt. Ziel der vorliegenden Arbeit war die Beschreibung intrazellulärer Signalwege von -Protocadherinen. Zuerst identifizierten wir Proteine, welche an die -Protocadherin spezifische intrazelluläre Domäne (-ICD) binden. Dazu reinigten wir polyklonale Antikörper gegen die -ICD und immunpräzipitierten damit Bindungspartner aus Maushirnlysaten. Mit Hilfe von massenspektrometrischen Analysen, gefolgt von Co-Immunpräzipitationen, konnten wir neue Interaktionspartner mit bereits bekannten Funktionen während synaptischer Plastizität finden. Um intrazelluläre Signalwege von -Protocadherinen und deren Interaktionspartnern in vivo besser zu verstehen, etablierten wir eine Methode zum Virus-vermittelten Gentransfer in neugeborene Mäuse. Diese Methode ermöglichte die Überexpression der -ICD, sowie die erste elektrophysiologische Beschreibung -Protocadherin induzierter Effekte an inhibitorischen Synapsen im Kortex.

Item Type: Dissertation
Supervisor: Seeburg, Prof. Peter,
Date of thesis defense: 27. March 2009
Date Deposited: 30. Mar 2009 14:58
Date: 2009
Faculties / Institutes: The Faculty of Bio Sciences > Dean's Office of the Faculty of Bio Sciences
Subjects: 570 Life sciences
Uncontrolled Keywords: Protocadherins , AAV
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