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PDF, English - main document Download (941kB) | Lizenz: HUBzero als open-source Science Gateway by Gauza, Holger ; Krüger, Jens ; Werner, Johannes ; Wannenmacher, Fabian ; Zajac, Thomas underlies the terms of Creative Commons Attribution 4.0

Abstract

Der offene Austausch von Forschungsdaten ist essentiell für die Kollaboration von Forschenden und steigert den Erkenntnisgewinn. Im Unterschied zu Plattformen für die Datenpublikation oder für kollaborative Zusammenarbeit ermöglichen Science Gateways eine umfänglichere Integration von Storage, Repositorien und HPC-Infrastrukturen und bieten darüber hinaus Module zur Interaktion und Dokumentation. Sie bieten damit der wissenschaftlichen Community webbasierten Zugang zu Analysewerkzeugen, Speicher und erleichtern das Projekt- und Wissensmanagement. Bisher erfolgt die Publikation von Forschungsdaten begleitend zu einer Publikation gegen Ende des Lebenszyklus von Forschungsdaten. In der Zeit zwischen Erstellung und Veröffentlichung der Forschungsdaten dürften die meisten Forschenden bei nationalen und internationalen Kollaborationen auf Dienste wie Google Drive, Dropbox oder von Rechenzentren bereitgestellte Infrastrukturen wie bwSync&Share sowie auf Wiki-Systeme zurückgreifen. Als primäres Kommunikationsmedium werden dabei E-Mail und Messengerdienste verwendet. Die Erfassung von disziplinspezifischen Metadaten während der Erstellung und Analyse von Daten im Sinne von untersuchter Spezies, untersuchtem Gewebe, Probenaufbereitung, verwendeten Workflows etc. erfolgt primär mittels verbreiteter Software für Tabellenkalkulation und über die bereits genannten Austausch- und Kommunikationskanäle. Gerade größere Projekte und Projekte mit hoher Personalfluktuation profitieren bei ihrer Arbeit von Wissensmanagement durch Wiki-Artikel oder bereitgestelltes Schulungsmaterial. HUBzero als open-source Framework für ein Science Gateway bietet zum einen ein Content Management System zum Aufbau einer zentralen, öffentlichen Webpage, zum anderen ein Framework zur Integration verschiedener Module, um Funktionen für die nutzende Community zu integrieren beziehungsweise dieser anzubieten. Ein Science Gateway auf Basis von HUBzero dient dem SDC BioDATEN als zentraler Einstiegspunkt für die wissenschaftliche Fachcommunity und ermöglicht dieser eine effektive Kommunikation, den Austausch von Daten, die Annotation von forschungsspezifischen Metadaten und Projekt- beziehungsweise Wissensmanagement. Gleichzeitig wird Forschenden der webbasierte Zugang zu HPC-Infrastrukturen für Analyse und Speicherung ermöglicht. Durch die Anbindung der Elixir AAI wird der Community ein etabliertes und verbreitetes single sign-on System für die Authentifizierung und Autorisierung angeboten. Forschende können selbstständig Projekte und Gruppen anlegen, um beispielsweise nur mit bestimmten Forschenden oder Gutachtern Daten auszutauschen oder die Projektarbeit durch interne To-do-Listen zu erleichtern. Ein Science Gateway auf Basis von HUBzero wird momentan im Rahmen von BioDATEN aufgebaut und aktuelle Entwicklungen wie die Integration der Elixir AAI und die Bereitstellung von Speicher sollen neben allgemeinen Funktionen des Science Gateways vorgestellt werden.