TY  - GEN
ID  - heidok10447
TI  - Dynamics of intracellular macromolecules: a mesoscopic simulation study
KW  - biological physics 
KW  -  computer simulations 
KW  -  coarse-grained molecular dynamics
Y1  - 2010///
A1  - Schmidt, Ulrich
AV  - public
UR  - https://archiv.ub.uni-heidelberg.de/volltextserver/10447/
N2  - Diese Arbeit untersucht mittels mesoskopischer Simulationsmethoden das dynamische Verhalten von Makromolekülen in lebenden Zellen. Im Fokus stehen die großen Molekülklassen der integralen Membranproteine und der flexiblen Biopolymere. Im ersten Teil dieser Arbeit wird untersucht welche Auswirkungen ein ?hydrophober Mismatch? (HM) mit der umgebenden Membran auf die Dynamik und das kollekive Verhalten integraler Membranproteine besitzt. Dieser geometrische Defekt führt zur Anziehung zwischen Proteinen mit gleichem HM und kann zur vollständigen Separation von Proteinen mit unterschiedlichem HM führen. Basierend auf diesen Ergebnissen schlagen wir ein Model vor, wie Membranproteine in lebenden Zellen verteilt werden. Weiterhin wird untersucht, ob und inwieweit Clustering von Membranproteinen deren Diffusionseigenschaften beeinflusst. Im zweiten Teil wenden wir uns der Bewegung eines flexiblen Polymers durch eine enge Pore zu. Wir untersuchen, wie sich das Translokationsverhalten des Polymers ändert, wenn die Qualität des Lösungsmittels auf beiden oder nur auf einer Seite der Pore verschlechtert wird. Überraschenderweise variiert das Translokationsverhalten im ersten Fall nicht, wohingegen im zweiten Fall eine Beschleunigung der Bewegung durch die Pore beobachtet wird.
ER  -