title: Structure Formation and Self-Organization in the Early Secretory Pathway
creator: Kühnle, Jens
subject: ddc-530
subject: 530 Physics
description: Im Rahmen dieser Dissertation werden di ffusionsgetriebene Struktur und Selbstorganisationprozesse im frühen sekretorischen Pfad von biologischen Zellen untersucht. Dies umfasst Prozesse im Endoplasmatischen Retikulum (ER), dem Golgi Apparat (GA) und deren Transporteinheiten. Mesoskopische Simulationsmethoden werden angewandt um Phänomene auf unterschiedlichen Längenskalen zu untersuchen. Auf der Mikrometerskala werden Selbsorganisationeigenschaften des GA untersucht und dessen erstaunliche Eigenschaft sich nach vollständigem Abbau wieder zu regenerieren. Desweiteren besitzen unterschiedliche Organismen eine große Bandbreite an GA Phänotypen. Sowohl die dynamische Regeneration als auch die Diversität an Phänotypen können in einem einfachen Modell durch Unterschiede in der Fusions- und Transportmaschinerie erklärt werden. Auf der Nanometerskala wird die Bildung von Transportvesikeln durch COPI Hüllenproteine untersucht. Zuerst wird die von ARFGAP verursachte Ablösung der COPI Hülle untersucht. Insbesondere zeigt sich, dass eine krümmungsabhängige ARFGAP-induzierte Ablösung der COPI Hülle für die Vesikelbildung vorteilhaft sein könnte. Anschließend wird ein Reaktions-Diffusions Modell hergeleitet, das sich mit der Bildung von COPI Domänen beschäftigt. Im Wesentlichen können diese Domänen durch Lipid-Protein Wechselwirkungen entstehen, d.h. bestimmte Proteine bevorzugen spezielle Lipidumgebungen und verändern gleichzeitig ihr Lipidmilieu.
date: 2011
type: Dissertation
type: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
type: NonPeerReviewed
format: application/pdf
identifier: https://archiv.ub.uni-heidelberg.de/volltextserverhttps://archiv.ub.uni-heidelberg.de/volltextserver/12079/1/phd_thesis_jens_kuehnle.pdf
identifier: DOI:10.11588/heidok.00012079
identifier: urn:nbn:de:bsz:16-opus-120792
identifier:   Kühnle, Jens  (2011) Structure Formation and Self-Organization in the Early Secretory Pathway.  [Dissertation]     
relation: https://archiv.ub.uni-heidelberg.de/volltextserver/12079/
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language: eng