TY  - GEN
AV  - public
TI  - Role of COPI paralogous proteins during pluripotent cells differentiation into neurons
CY  - Heldelberg
N2  - Abstract

Coat protein complex I (COPI) vesicles coated with the heptameric complex coatomer mediate retrograde cargo trafficking from Golgi to endoplasmic reticulum as well as intra-Golgi transport. Whether paralogous subunits of coatomer have different functions is currently unclear. In this thesis, we reveal distinct roles of paralogous coatomer subunits ?1-COP and ?2-COP during the neuronal differentiation of mouse pluripotent cells. Following genome editing experiments, our work shows that ?1-COP specifically facilitates neurite extension and underlines a paralogue-specific function of the COPI pathway and offers evidence for the role of COPI coated vesicles in neuronal polarization. Furthermore, to explore the mechanism of ?1-COP specific functions during pluripotent cells differentiation into neurons, the combination proximity-dependent biotinylation with affinity purification and mass spectrometry (AP-MS) was applied to analyze whether the interactome of ?-COPs reveals paralogue-specific cargos or regulators. In the light of label free quantification (LFQ) analysis, various neurogenesis-related proteins were significantly enriched in the ?1-COP interactome indicating that ?1-COP may preferentially traffic such proteins during the process of pluripotent cells neuronal differentiation.


Zusammenfassung

Mit dem heptameren Komplex-Coatomer beschichtete Coat Protein Complex I (COPI) -Vesikel vermitteln den retrograden Frachthandel von Golgi zum endoplasmatischen Retikulum sowie den Intra-Golgi-Transport. Ob paraloge Untereinheiten des Coatomers unterschiedliche Funktionen haben, ist derzeit unklar. In dieser Arbeit zeigen wir unterschiedliche Rollen der paralogen Coatomer-Untereinheiten ?1-COP und ?2-COP während der neuronalen Differenzierung pluripotenter Mauszellen. Nach Experimenten zur Bearbeitung des Genoms zeigen unsere Arbeiten, dass ?1-COP die Neuritenverlängerung spezifisch erleichtert, eine paralogspezifische Funktion des COPI-Signalwegs unterstreicht und Hinweise auf die Rolle von COPI-beschichteten Vesikeln bei der neuronalen Polarisation liefert. Um den Mechanismus der ?1-COP-spezifischen Funktionen während der Differenzierung pluripotenter Zellen in Neuronen zu untersuchen, wurde die kombinationsnäherungsabhängige Biotinylierung mit Affinitätsreinigung und Massenspektrometrie (AP-MS) angewendet, um zu analysieren, ob das Interaktom von ?-COPs Paralog zeigt. spezifische Ladungen oder Regulierungsbehörden. Im Lichte der Analyse der markierungsfreien Quantifizierung (LFQ) wurden verschiedene Neurogenese-verwandte Proteine im ?1-COP-Interaktom signifikant angereichert, was darauf hinweist, dass ?1-COP solche Proteine während des Prozesses der neuronalen Differenzierung pluripotenter Zellen bevorzugt transportieren kann.
A1  - Zhao, Xiyan
UR  - https://archiv.ub.uni-heidelberg.de/volltextserver/30331/
ID  - heidok30331
Y1  - 2021///
ER  -