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type: doctoralThesis
metadata_visibility: show
creators_name: Gerstberger, Thomas Christian
title: Identifizierung von nukleären Export-Substraten mittels eines funktionellen Testsystems für nukleäre Exportsignale (NES) in der Hefe Saccharomyces cerevisiae
title_en: Identification of nuclear export substrates via a functional test system for nuclear export signals (NES) in the baker's yeast Saccharomyces cerevisiae
ispublished: pub
subjects: 570
divisions: 711000
adv_faculty: af-14
keywords: Nukleozytoplasmatischer Transport , Nukleäre Exportsignale (NES) , in vivo Testsystem , Exportsubstrate , Exportadaptorennucleocytoplasmic transport , nuclear export signal (NES) , exportsubstrates , in vivo method , nuclare pore
cterms_swd: Intrazellulärer Transport
cterms_swd: Zellkern
cterms_swd: Cytoplasma
cterms_swd: Kernpore
cterms_swd: In vivo
abstract: Der aktive Transport von Makromolekülen zwischen Zellkern und Zytoplasma wird durch lösliche Transportrezeptoren vermittelt, die ihre Substrate über spezifische Sequenzmotive erkennen und binden können. Je nach Richtung der anschließenden Translokation wird bei den Erkennungssequenzen zwischen nukleären Lokalisierungssignalen (NLS) und nukleären Exportsignalen (NES) unterschieden. Da insbesondere der nukleäre Export von Proteinen bei regulatorischen Prozessen und der Biogenese von RNA/Protein-Partikeln eine wichtige Rolle spielt, wurde in dieser Arbeit ein Assay entwickelt, der die funktionelle Identifizierung neuer Exportsignale erlaubt. Nachdem die Funktionalität dieses Systems anhand verschiedener NES-Kontrollsequenzen bestätigt worden war, wurde eine Durchmusterung des Hefegenoms nach neuen NES durchgeführt. Dabei konnten 77 Kandidaten, die eine in diesem System aktive Exportfunktion zeigen, identifiziert werden. Zwei dieser Kandidaten (mit Sequenzbereichen aus Bfr1p und Rpn11p) konnte trotz der gefundenen NES-Funktion und näherer Untersuchungen in bekannten Transportinmutanten bis jetzt noch kein Exportin zugeordnet werden. Für drei Kandidaten (mit Sequenzbereichen aus Nip1p, Scd5p und Rpl5p) konnte ein durch das Exportin Xpo1p vermittelter nukleärer Export nachgewiesen werden. Der als NES identifizierte Aminosäurebereich eines dieser Proteine, Rpl5p, wurde aufgrund einer möglichen Beteiligung am Export der ribosomalen 60S Untereinheit näher charakterisiert. Die NES in Rpl5p konnte durch den entwickelten funktionellen Assay weiter eingegrenzt werden und zeigt eine signifikante Homologie zum typischen Konsensusmotiv einer Leucin-reichen NES, der klassischen Erkennungssequenz des Exportins Xpo1p. Eingehende Deletions- und Mutationsanalysen der gefundenen NES-Domäne zeigten einen Funktionsverlust, nukleäre Akkumulation und Defekte in der Ribosomenbiogenese. Allerdings konnte eine direkte Beteiligung von Rpl5p am Export der ribosomalen 60S Untereinheit nicht nachgewiesen werden.
abstract_translated_text: Identification of nuclear export substrates via a functional test system for nuclear export signals (NES) in the baker's yeast Saccharomyces cerevisiae.
abstract_translated_lang: eng
class_scheme: mesh
class_labels: Active Transport, Cell Nucleus
date: 2002
date_type: published
id_scheme: DOI
id_number: 10.11588/heidok.00003222
ppn_swb: 1643406221
own_urn: urn:nbn:de:bsz:16-opus-32220
date_accepted: 2003-02-10
advisor: HASH(0x556120927ba0)
language: ger
bibsort: GERSTBERGEIDENTIFIZI2002
full_text_status: public
citation:   Gerstberger, Thomas Christian  (2002) Identifizierung von nukleären Export-Substraten mittels eines funktionellen Testsystems für nukleäre Exportsignale (NES) in der Hefe Saccharomyces cerevisiae.  [Dissertation]     
document_url: https://archiv.ub.uni-heidelberg.de/volltextserver/3222/1/TGerstbergerDiss.pdf