TY  - GEN
UR  - https://archiv.ub.uni-heidelberg.de/volltextserver/7353/
Y1  - 2007///
ID  - heidok7353
AV  - public
TI  - Proteins and RNA sequences regulating gene expression in Trypanosoma brucei
N2  - Trypanosoma brucei, der afrikanische Trypanosomiasis oder Schlafkrankheit verursacht, ist einer der bisher am besten untersuchten biologischen Modellorganismen. Um sich an unterschiedliche Umgebungen anzupassen, reguliert dieser Parasit die Genexpression posttranskriptionell, hauptsächlich über mRNS Stabilität und Translation. Diese Prozesse werden durch die Interaktion zwischen Sequenzen, die sich in der 3'-UTR befinden und Proteinen reguliert. Trotz ihrer Rolle in vielen Aspekten des RNS-Metabolismus ist die Funktion der meisten RRM-Proteine unbekannt. Der erste Teil dieser Arbeit beschäftigt sich mit der Charakterisierung von RBP3 und seiner Rolle in der post-transkriptionellen Kontrolle. Orthologue dieses Proteins findet man in T. cruzi, T. congolense und L. major. Überexpression und Hemmung von TbRBP3 mittels RNAi zeigen eine stadium-spezifische Rolle für dieses Protein in den Blutstromzellen an. Microarraystudien, die Wildtypzellen mit TbRBP3-RNAi oder ?überexprimierenden Zellen vergleichen, führten nicht zur Identifikation einer Ziel-mRNS. Diese Ergebnisse weisen daraufhin, dass dieses Protein keine Funktion bei der Kontrolle von mRNS Mengen hat. Isolation der TbRBP3-RNP Komplexe erlaubte die Identifizierung von verschiedenen mRNS, die selektiv dieses Protein binden. Insbesondere wurden die Interaktion der cyclin F-Box und ZFP-mRNS durch RT-PCR bestätigt und die Rolle der Überexpression von TbRBP3 auf mRNA Levels wurde durch Northernblotanalyse untersucht. Versuche, TbRBP3-Interaktionpartner in T. brucei zu finden, blieben erfolglos. Versuche, um die Rolle dieses Proteins festzustellen werden durchgeführt. Spezifische Sequenzen, die sich in der 3-UTR von stadiumspezifischen Genen befinden, sind an mRNS Stabilität und Translation beteiligt. In dieser Arbeit wurden regulierende Elemente identifiziert, die an der Entwicklungskontrolle des Aminosäuretransporters 11 beteiligt sind. Die Region zwischen nt 290-618 dieser 3'-UTR ist für die geringere Abundanz der mRNS eines CAT Reportergens in der Blutstromform verantwortlich. Außerdem wurden noch zwei Elemente gefunden, die in translationelle Repression verwickelt sind. Versuche, um AATP 11-3?-UTR-Interaktionsproteine unter physiologischen Konditionen zu finden, waren erfolglos. Experimente unter in vitro Bedingungen werden vorgeschlagen.
KW  - RNS-bindenden protein 
KW  -  Trypanosoma 
KW  -  3'-UTR 
KW  -  GenexpressionRNA binding protein 
KW  -  Trypanosoma 
KW  -  3'-UTR 
KW  -  gene expression
A1  - Robles Nieto, Ana Patricia
ER  -