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Multi-Modal Partial Surface Matching for Intra-Operative Registration

Ramos dos Santos, Thiago

German Title: Multi-modales partielles Oberflächenmatching für intra-operative Registrierung

PDF, English
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An important task for computer-assisted surgical interventions is the alignment of pre- and intra-operative spaces allowing the transfer of pre-operative information to the current patient situation, known as intra-operative registration. Registration is usually performed by using markers or image-based techniques. Another approach is the intra-operative acquisition of organ surfaces by 3D range scanners, which are then matched to pre-operatively generated surfaces. However, this approach is not trivial, as methods for intra-operative surface matching must be able to deal with noise, distortions, deformations, and the availability of only partially overlapping, nearly flat surfaces. For these reasons, surface matching for intra-operative registration has so far only been used to account for displacements that occur in local scales, while the actual alignment is still performed manually. The main contributions of this thesis are two different approaches for automatic surface matching in intra-operative environments. The focus here is the registration of surfaces acquired by different modalities, dealing with the aforementioned issues and without relying on unique landmarks. For the first approach, surfaces are converted to graph representations and correspondences between them are identified by means of graph matching. Graphs are obtained automatically by segmenting the surfaces into regions with similar properties. As the graph matching problem is known to be NP-hard, it was solved by iteratively computing node similarity scores, and converting it to a linear assignment problem. In the second approach, correspondences are identified by the selection of two spatial configurations of landmarks that can be better fitted to each other, according to an error metric. This error metric does not only incorporate a fitting error, but also a new measure for spatial configuration reliability. The optimization problem is solved by means of a greedy algorithm. Evaluation of the two approaches was performed with several experiments, simulating intra-operative conditions. While the graph matching approach proved to be robust for the registration of small partial data, the point-based approach proved to be more reliable for noisy surfaces. Apart from being a significant contribution to the field of feature-less partial surface matching, this work represents a great effort towards the achievement of a fully automatic, marker-less, registration system for computer-assisted surgery guidance.

Translation of abstract (German)

Die Übertragung präoperativer Daten auf die intraoperative Situation am Patienten ist ein wichtiger Bestandteil jeder computergestützten Intervention. Diese intraoperative Registrierung wird gewöhnlich marker- oder bildbasiert durchgeführt. Andere Ansätze nutzen die intraoperative Erfassung der Organoberfläche mittels 3D-Tiefenmessung, welche eine Registrierung zur präoperativ akquirierten Oberfläche ermöglicht. Dieser Ansatz ist jedoch nicht trivial, da hier Rauschen, Verzerrungen und Verformungen auftreten sowie häufig nur teilweise überlappende, beinahe flache Oberflächen vorliegen. Wegen dieser Schwierigkeiten wurde intraoperative Oberflächenregistrierung bis jetzt nur lokal angewandt, während die globale Registrierung noch manuell durchgeführt wird. In dieser Arbeit werden zwei verschiedene Ansätze zur automatischen, markerlosen Oberflächenregistrierung für intraoperative Szenarien vorgestellt, wobei insbesondere o.g. Probleme berücksichtigt werden. Für den ersten Ansatz werden Oberflächen als Graph repräsentiert und Korrespondenzen zwischen ihnen mittels Graph-Matching identifiziert. Da das Graph-Matching Problem bekanntlich NP-hart ist, wurde ein iteratives Verfahren basierend auf der Bewertung der Knotenähnlichkeiten gewählt und dadurch in ein lineares Zuweisungsproblem überführt. In dem zweiten Ansatz werden Korrespondenzen durch die Auswahl von zwei räumlichen Konfigurationen von Landmarken bestimmt, die in Bezug auf ihre Fehlermetrik besser zugeordnet werden können. Diese Fehlermetrik berücksichtigt nicht nur den Zuordnungsfehler, sondern auch ein neues Maß für die Verlässlichkeit von räumlichen Konfigurationen. Die Registrierung wird dann mit Hilfe eines Greedy Optimisierungsalgorithmus gelöst. Beide Ansätze wurden in etlichen Experimenten, welche die intraoperativen Bedingungen simulierten, evaluiert. Es konnte gezeigt werden, dass der Graph-Matching-Ansatz ins besondere für die Registrierung von kleinen Teiloberflächen geeignet ist, während der punkt-basierte Ansatz bei hohem Rauschen robust und akkurat war. Neben dem signifikanten Beitrag zur partiellen Oberflächenregistrierung ist diese Arbeit von besondere Bedeutung zur Erreichung von vollautomatischer, markerloser und intraoperativer Registrierung für computerassistierte Assistenzsysteme.

Item Type: Dissertation
Supervisor: Schnörr, Prof. Dr. Christoph
Date of thesis defense: 10 May 2012
Date Deposited: 16 May 2012 10:26
Date: 2012
Faculties / Institutes: The Faculty of Mathematics and Computer Science > Department of Computer Science
Subjects: 004 Data processing Computer science
Controlled Keywords: Registrierung <Bildverarbeitung>
Uncontrolled Keywords: Oberflächenregistrierung , MarkeloseSurface matching , graph matching , intra-operative registration , markerless
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